Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apba1B2RUJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apba1B2RUJ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apba1B2RUJ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms