Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf518aB2RRF6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Znf518aB2RRF6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Znf518aB2RRF6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf518aB2RRF6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf518aB2RRF6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Znf518aB2RRF6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Znf518aB2RRF6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms