Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ythdc2B2RR83 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ythdc2B2RR83 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Ythdc2B2RR83 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ythdc2B2RR83 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ythdc2B2RR83 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ythdc2B2RR83 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms