Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbed5B2RPU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed5B2RPU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed5B2RPU8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed5B2RPU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms