Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB1P1B2RPK0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HMGB1P1B2RPK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGB1P1B2RPK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms