Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1bp1B2KF50 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uhrf1bp1B2KF50 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms