Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nfx1B1AY10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfx1B1AY10 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfx1B1AY10 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nfx1B1AY10 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfx1B1AY10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nfx1B1AY10 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nfx1B1AY10 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms