Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK3BL1B0FP48 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK3BL1B0FP48 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK3BL1B0FP48 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK3BL1B0FP48 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms