Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC1A8K0Z3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC1A8K0Z3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WASHC1A8K0Z3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms