Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYE4A6NLX3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SPDYE4A6NLX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPDYE4A6NLX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPDYE4A6NLX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPDYE4A6NLX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPDYE4A6NLX3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYE4A6NLX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.9 ms