Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF233A6NK53 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNF233A6NK53 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF233A6NK53 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF233A6NK53 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms