Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC01549A6NIU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms