Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C5orf60A6NFR6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C5orf60A6NFR6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms