Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L9A6NEM1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L9A6NEM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms