Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4D1N5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4D1N5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A4D1N5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A4D1N5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A4D1N5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A4D1N5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A4D1N5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A4D1N5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A4D1N5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A4D1N5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4D1N5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4D1N5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4D1N5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4D1N5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4D1N5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4D1N5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A4D1N5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4D1N5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4D1N5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
A4D1N5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4D1N5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4D1N5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4D1N5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4D1N5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
A4D1N5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A4D1N5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4D1N5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
A4D1N5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4D1N5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4D1N5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4D1N5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A4D1N5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4D1N5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A4D1N5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A4D1N5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4D1N5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4D1N5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4D1N5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4D1N5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A4D1N5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4D1N5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4D1N5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4D1N5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4D1N5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4D1N5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4D1N5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4D1N5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4D1N5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A4D1N5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4D1N5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4D1N5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4D1N5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4D1N5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4D1N5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4D1N5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A4D1N5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4D1N5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4D1N5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4D1N5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms