Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM30A4D0T7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM30A4D0T7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms