Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Odf2A3KGV1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Odf2A3KGV1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Odf2A3KGV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms