Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC66A2RUB6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC66A2RUB6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC66A2RUB6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms