Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga8A2ARA8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga8A2ARA8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga8A2ARA8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms