Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom2A2ALU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Shroom2A2ALU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Shroom2A2ALU4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Shroom2A2ALU4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Shroom2A2ALU4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Shroom2A2ALU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom2A2ALU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms