Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itgb4A2A863 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Itgb4A2A863 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Itgb4A2A863 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itgb4A2A863 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms