Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf19bA2A7Q9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf19bA2A7Q9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms