Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdr2lA2A6T1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms