Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul4bA2A432 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul4bA2A432 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul4bA2A432 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul4bA2A432 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms