Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCE3A1L190 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYCE3A1L190 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms