Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEB3A0JP26 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEB3A0JP26 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
POTEB3A0JP26 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms