Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV2A0A0J9YWF9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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