Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC034090A0A087WP46 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC034090A0A087WP46 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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