Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam228bQ497Q6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms