Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.153e-25■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-13■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.411e-13■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.421e-13■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.174e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.354e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-214ENST00000461469 560 ntTSL 324.59■■□□□ 1.531e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-209ENST00000434453 2229 ntTSL 523.74■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-211ENST00000444719 762 ntTSL 323.08■■□□□ 1.291e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-205ENST00000430278 523 ntTSL 422.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-207ENST00000433968 578 ntTSL 422.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 522.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-217ENST00000485985 644 ntTSL 222.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-203ENST00000414218 451 ntTSL 521.85■■□□□ 1.091e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-219ENST00000498034 478 ntTSL 321.6■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-208ENST00000434278 678 ntTSL 521.05■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GARS-203ENST00000454308 814 ntTSL 520.27■□□□□ 0.841e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 218.71■□□□□ 0.591e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 PDLIM7-216ENST00000506537 636 ntTSL 218.33■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SPAG9-215ENST00000513746 822 ntTSL 518.26■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 316.23■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CENPF-202ENST00000464322 689 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-12■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SNRNP200-204ENST00000480615 1646 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LARS-208ENST00000506436 539 ntTSL 313.03□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-203ENST00000547526 644 ntTSL 312.58□□□□□ -0.41e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 MCM4-205ENST00000518680 862 ntTSL 512.33□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MCM4-202ENST00000517709 842 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC116366.3-201ENST00000638452 7893 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.03□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-201ENST00000346473 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RAD50-209ENST00000533482 4373 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LARS-206ENST00000505223 582 ntTSL 311.34□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 AKAP9-211ENST00000487258 3983 ntTSL 29.28□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RAD50-206ENST00000455677 564 ntTSL 57.16□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.891e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 221.18■□□□□ 0.987e-21■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-206ENST00000569871 845 ntTSL 516.96■□□□□ 0.314e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-205ENST00000564620 812 ntTSL 215.94■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-202ENST00000561677 582 ntTSL 214.25□□□□□ -0.134e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HDGFL2-209ENST00000619255 320 ntTSL 320.04■□□□□ 0.83e-11■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 418.44■□□□□ 0.543e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 516.41■□□□□ 0.223e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.583e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.673e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-215ENST00000526950 1847 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-217ENST00000527688 3858 ntTSL 29.78□□□□□ -0.843e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-204ENST00000429002 3855 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.023e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.073e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.113e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.223e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-212ENST00000480226 585 ntTSL 46.58□□□□□ -1.363e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.373e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.433e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 45.64□□□□□ -1.513e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.673e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-206ENST00000437302 445 ntTSL 54.16□□□□□ -1.743e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 43.12□□□□□ -1.913e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.398e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 528.83■■■□□ 2.218e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 327.13■■□□□ 1.938e-6■□□□□ 8.1
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