Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RHOT2-212ENST00000564659 854 ntTSL 217.74■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-211ENST00000541434 1112 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.364e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-211ENST00000558314 1031 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.334e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.294e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 416.87■□□□□ 0.294e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.294e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 216.39■□□□□ 0.224e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 SLC13A5-207ENST00000572727 618 ntTSL 216.18■□□□□ 0.184e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.174e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-228ENST00000560975 2855 ntTSL 515.95■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-230ENST00000561266 671 ntTSL 315.32■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RNF167-216ENST00000576965 599 ntTSL 515.28■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RNF167-206ENST00000572382 989 ntTSL 215.03■□□□□ -04e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDC42EP1-204ENST00000434728 564 ntTSL 414.92□□□□□ -0.024e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RNF167-207ENST00000572430 1511 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RHOT2-220ENST00000569197 530 ntTSL 513.31□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.344e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-227ENST00000560970 1039 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.54e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-212ENST00000558347 1525 ntTSL 511.26□□□□□ -0.614e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RHOT2-208ENST00000562957 397 ntTSL 210.99□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-212ENST00000542447 4223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TGFBR3-206ENST00000470600 574 ntTSL 29.55□□□□□ -0.884e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-233ENST00000610733 3957 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.924e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RELN-207ENST00000478148 612 ntTSL 37.98□□□□□ -1.134e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 ABHD12-205ENST00000465694 474 ntTSL 27.83□□□□□ -1.164e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 AZGP1-206ENST00000495765 540 ntTSL 27.36□□□□□ -1.234e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-214ENST00000543249 565 ntTSL 46.54□□□□□ -1.364e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-16■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 SF1-214ENST00000477596 802 ntTSL 224.7■■□□□ 1.549e-8■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RALY-207ENST00000481580 773 ntTSL 226.12■■□□□ 1.776e-9■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.918e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 218.83■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CALR-205ENST00000587486 957 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-14■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.492e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 216.33■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.173e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 516.02■□□□□ 0.166e-9■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CALR-207ENST00000590325 781 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-14■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-208ENST00000561059 947 ntTSL 214.83□□□□□ -0.043e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 514.83□□□□□ -0.043e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PKM-207ENST00000562997 582 ntTSL 411.39□□□□□ -0.596e-9■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 311.15□□□□□ -0.623e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PKM-210ENST00000564178 554 ntTSL 410.35□□□□□ -0.756e-9■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 510.28□□□□□ -0.763e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDK12-206ENST00000581593 559 ntTSL 35.49□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 PSME1-203ENST00000470718 476 ntTSL 33.81□□□□□ -1.83e-7■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.316e-61■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 SLC2A1-205ENST00000475162 598 ntTSL 515.79■□□□□ 0.122e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-17■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ADNP2-204ENST00000560752 880 ntTSL 530.64■■■□□ 2.51e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ARID3A-204ENST00000585895 377 ntTSL 228.78■■■□□ 2.21e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ADNP2-202ENST00000559951 823 ntTSL 323.28■■□□□ 1.321e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.461e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ADNP2-203ENST00000560561 647 ntTSL 36.67□□□□□ -1.341e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ADNP2-205ENST00000561195 124 ntTSL 36.62□□□□□ -1.351e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 212.98□□□□□ -0.332e-11■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.419e-13■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.459e-13■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 317.08■□□□□ 0.329e-13■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 312.98□□□□□ -0.339e-13■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 RPLP2-205ENST00000527517 646 ntTSL 212.63□□□□□ -0.399e-13■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 212.5□□□□□ -0.419e-13■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 212.5□□□□□ -0.419e-13■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 GTPBP2-203ENST00000419497 1394 ntTSL 217.45■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 GTPBP2-204ENST00000432918 1850 ntTSL 313.38□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 GTPBP2-208ENST00000476510 2816 ntTSL 511.58□□□□□ -0.561e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 GTPBP2-210ENST00000496137 516 ntTSL 37.47□□□□□ -1.211e-7■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ARF5-205ENST00000467281 567 ntTSL 422.47■■□□□ 1.195e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 ARF5-206ENST00000489673 566 ntTSL 219.41■□□□□ 0.75e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 SRM-204ENST00000475189 545 ntTSL 217.95■□□□□ 0.464e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.318e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.265e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.265e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 215.44■□□□□ 0.065e-6■□□□□ 10.3
PCBP1Q15365 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 213.71□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 10.3
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