Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SERPINA1-219ENST00000557492 951 ntTSL 413.76□□□□□ -0.216e-38■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-204ENST00000402629 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.316e-38■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 SERPINA1-212ENST00000554720 446 ntTSL 57.81□□□□□ -1.166e-38■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 TMEM132D-AS1-201ENST00000508925 627 ntTSL 1 (best)8.02□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.863e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 MED15-212ENST00000436496 393 ntTSL 316.93■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 ETV4-210ENST00000590236 616 ntTSL 317.55■□□□□ 0.41e-8■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 NUP214-224ENST00000530863 560 ntTSL 55.2□□□□□ -1.585e-10■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 AES-210ENST00000590067 1100 ntTSL 218.48■□□□□ 0.558e-8■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 GSN-202ENST00000373807 2823 ntTSL 217.36■□□□□ 0.371e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 514.29□□□□□ -0.125e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.985e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 528.08■■■□□ 2.095e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)26.64■■□□□ 1.865e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 222.49■■□□□ 1.195e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.075e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.855e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.845e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 219.3■□□□□ 0.685e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 ARID1A-207ENST00000524572 546 ntTSL 411.92□□□□□ -0.55e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 39.78□□□□□ -0.845e-12■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-206ENST00000439994 671 ntTSL 526.26■■□□□ 1.792e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-207ENST00000460939 1770 ntTSL 524.6■■□□□ 1.532e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 324.23■■□□□ 1.472e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 520.14■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.26■□□□□ 0.672e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-203ENST00000394776 2818 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 218.62■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.42e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PLK1-208ENST00000568568 582 ntTSL 316.79■□□□□ 0.282e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PLK1-207ENST00000567897 711 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 EML3-213ENST00000494448 3665 ntTSL 213.84□□□□□ -0.192e-14■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 BICD1-201ENST00000281474 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 BICD1-202ENST00000395758 3194 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.372e-6■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.199e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PGGHG-205ENST00000474221 4418 ntTSL 213.7□□□□□ -0.229e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.319e-7■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.76e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.876e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.876e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.896e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 MLXIPL-209ENST00000467221 774 ntTSL 512.13□□□□□ -0.473e-8■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TMED9-202ENST00000505521 925 ntTSL 220.83■□□□□ 0.932e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.592e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 215.96■□□□□ 0.152e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 213.12□□□□□ -0.312e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TMED9-205ENST00000510499 821 ntTSL 210.75□□□□□ -0.692e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TMED9-203ENST00000507578 144 ntTSL 52.94□□□□□ -1.942e-10■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 SRRM2-210ENST00000572721 841 ntTSL 215.57■□□□□ 0.083e-17■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.244e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.914e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-207ENST00000537140 1646 ntTSL 1 (best)24.2■■□□□ 1.464e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 323.55■■□□□ 1.364e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.364e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.334e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDK6-205ENST00000491250 558 ntTSL 423.2■■□□□ 1.34e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-232ENST00000561425 582 ntTSL 523.01■■□□□ 1.274e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 422.87■■□□□ 1.254e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.224e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-210ENST00000540951 572 ntTSL 321.23■□□□□ 0.994e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 521.07■□□□□ 0.964e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 221.04■□□□□ 0.964e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 320.99■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.94e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.814e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.04■□□□□ 0.84e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 219.78■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.744e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 218.62■□□□□ 0.574e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.554e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CADM1-218ENST00000545380 2373 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.494e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.484e-6■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 CDC42EP1-202ENST00000415670 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 318■□□□□ 0.474e-6■□□□□ 10.4
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