Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RhoP15409 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhoP15409 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoP15409 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms