Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5cP41230 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5cP41230 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms