Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoP15409 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhoP15409 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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