Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms