Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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