Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhoP15409 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhoP15409 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms