Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
V9GYQ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
V9GYQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
V9GYQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
V9GYQ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
V9GYQ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
V9GYQ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
V9GYQ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
V9GYQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GYQ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
V9GYQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V9GYQ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GYQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GYQ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GYQ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
V9GYQ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GYQ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GYQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GYQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
V9GYQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V9GYQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GYQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GYQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GYQ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GYQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GYQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V9GYQ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GYQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GYQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GYQ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GYQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
V9GYQ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
V9GYQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GYQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GYQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GYQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GYQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GYQ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GYQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V9GYQ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GYQ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GYQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GYQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
V9GYQ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GYQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
V9GYQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GYQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GYQ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GYQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
V9GYQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GYQ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GYQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GYQ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GYQ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GYQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GYQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GYQ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GYQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GYQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GYQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
V9GYQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GYQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GYQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GYQ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GYQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GYQ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GYQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GYQ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms