Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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ARL2-SNX15V9GYD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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