Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQV3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQV3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQV3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQV3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
U3KQV3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQV3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQV3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQV3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQV3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQV3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQV3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQV3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQV3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQV3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQV3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQV3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQV3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQV3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQV3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQV3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQV3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQV3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQV3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQV3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQV3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQV3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQV3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQV3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U3KQV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQV3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQV3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQV3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQV3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQV3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQV3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQV3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQV3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQV3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQV3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQV3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQV3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQV3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQV3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQV3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQV3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQV3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQV3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQV3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQV3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQV3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms