Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vstm4T1NXB5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vstm4T1NXB5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vstm4T1NXB5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms