Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mbd3Q9Z2D8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mbd3Q9Z2D8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mbd3Q9Z2D8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms