Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms