Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn7Q9Z261 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn7Q9Z261 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn7Q9Z261 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms