Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdf11Q9Z1W4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdf11Q9Z1W4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdf11Q9Z1W4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdf11Q9Z1W4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdf11Q9Z1W4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdf11Q9Z1W4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gdf11Q9Z1W4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gdf11Q9Z1W4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gdf11Q9Z1W4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gdf11Q9Z1W4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms