Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema4fQ9Z123 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4fQ9Z123 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4fQ9Z123 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4fQ9Z123 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4fQ9Z123 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4fQ9Z123 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms