Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC23IPQ9Y6Y8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC23IPQ9Y6Y8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms