Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KL1Q9Y6S9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KL1Q9Y6S9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1Q9Y6S9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms