Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPG1Q9Y678 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPG1Q9Y678 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPG1Q9Y678 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms